以前由于对扁桃体的功能不够了解，被视为如阑尾一样，是人体中没有作用的器官，因而有些医生主张普遍把小孩的扁桃体割掉。近年来的研究表明，扁桃体内有淋巴组织、浆细胞和参与细胞免疫的T细胞、B细胞；能产生各种免疫球蛋白和特殊抗体；还能分泌干扰素，抑制细菌生长。因此，它是人体的防御器官，参与人体免疫功能网络，其免疫力在3～5岁的儿童身上表现最为活跃。因此对5岁以下儿童，切除扁桃体要慎重。

　从免疫理论看，扁桃体确实很有用。但是从治疗角度看，若扁桃体有严重感染，反复发炎，影响咽鼓管功能，使听力受影响；或引起反复发作的关节炎、风湿病、哮喘等疾病。这时，扁桃体对身体健康不但无益，还给人体带来更多痛苦，那就应该施行扁桃体切除术。一般而言，儿童时期的扁桃体多呈生理性肥大，是正常现象，当这种生理性肥大影响到呼吸、吞咽和发音时，则应将扁桃体手术切除。