慢性肾炎不是一个单一的疾病，是由不同病因引起，只有少部分是由急性链球菌感染后肾炎迁延不愈而转入，大多数并非由急性肾炎迁延而致，直到目前大多数   慢性肾炎的病因仍不清楚，可能与细菌、病毒感染、过敏等因素有关。 
        目前认为多数人类肾小球肾炎是免疫介导的疾病。免疫机制是疾病的始发机制，在此基础上，在炎症介质（如补体、白细胞介素、活性氧和多肽类生长因子等）参与下，最后导致肾小球损伤和临床症状的产生。
        目前认识的多种致肾炎的抗原可分为两大类：
        外源性抗原：药物、食物、异种血清、细菌（如β溶血性链球菌、肺炎双球菌、、白色葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、伤寒沙门菌、麻风分枝杆菌、肺炎克雷伯菌等）、病毒（如乙型肝炎病毒、EB病毒、流行性出血热病毒、麻疹病毒、柯萨奇病毒等）肺炎支原体、梅毒螺旋体、真菌（如白色念珠菌）、寄生虫（疟原虫、鼠弓形体等）。
        内源性抗原：细胞核抗原（如双链DNA、ENA）、细胞浆（如嗜中性粒细胞胞浆抗原）、红细胞抗原、肿瘤抗原、免疫球蛋白、肾小管抗原等。